На основании подп. 3 п. 2 ст. 170 гл. 21 НК РФ суммы НДС, предъявленные подрядными организациями при проведении ими строительства объектов недвижимости, введённых в эксплуатацию в период применения организацией УСН, подлежат включению в первоначальную стоимость этих объектов недвижимости.

При этом после перехода организации на общий режим налогообложения в связи с утратой права на применение УСН указанные суммы НДС на основании п. 6 ст. 346.25 гл. 26.2 НК РФ к вычету не принимаются.
Об этом сообщил Минфин России в Письме от 09.02.2012 № 03-07-11/36.
Источник: "Экономика и жизнь" http://www.eg-online.ru