Расходы на прекращённое строительство в качестве затрат на производство, не давшее продукции, могут быть учтены в целях налогообложения на основании подп. 11 п. 1 ст. 265 НК РФ, если имеется достаточное экономическое обоснование для прекращения производственного процесса.

Конечно же, организация должна располагать соответствующими оправдательными документами, служащими основанием для признания таких расходов. Кроме того, необходимо, чтобы расходы были понесены в связи с осуществлением деятельности компании, направленной на получение доходов (п. 1 ст. 252 НК РФ).
Что касается НДС, то на основании п. 2 и 3 ст. 170 НК РФ этот налог подлежит восстановлению в случаях, когда приобретённые товары (работы, услуги), в том числе основные средства, не используются для операций по реализации товаров (работ, услуг), облагаемых данным налогом. В связи с этим необходимо восстановить суммы НДС, ранее правомерно принятые к вычету по товарам (работам услугам), приобретённым для производства, не давшего продукции, реализация которой учитывалась бы при определении налоговой базы по НДС.
Такие разъяснения даны в Письме Минфина России от 29.03.2012 № 03-03-06/1/163.
Источник: "Экономика и жизнь" http://www.eg-online.ru